Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6871L7N248 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6871L7N248 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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