Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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