Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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