Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20918J3QN17 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20918J3QN17 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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