Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20834J3QM72 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20834J3QM72 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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