Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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