Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfgef1G3X9K3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms