Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms