Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms