Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms