Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Gm20538F6Z9R1 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms