Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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