Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm340F6RGI3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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