Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4841E9QAA8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4841E9QAA8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms