Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms