Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
BC035044E0CXF8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BC035044E0CXF8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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BC035044E0CXF8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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BC035044E0CXF8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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BC035044E0CXF8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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BC035044E0CXF8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC035044E0CXF8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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