Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms