Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms