Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nlrc5C3VPR6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nlrc5C3VPR6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nlrc5C3VPR6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nlrc5C3VPR6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms