Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cttnbp2B9EJA2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms