Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms