Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms