Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms