Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms