Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nfx1B1AY10 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms