Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2-M5A7VMS3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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