Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prr16A3KMN5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr16A3KMN5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr16A3KMN5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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