Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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