Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Samt1A2BED8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Samt1A2BED8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Samt1A2BED8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Samt1A2BED8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Samt1A2BED8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Samt1A2BED8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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