Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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