Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms