Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam43bA2AM80 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms