Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms