Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms