Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms