Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Myom3A2ABU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myom3A2ABU4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms