Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnksr1A2A9K7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnksr1A2A9K7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms