Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms