Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprfA2A8L5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms