Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RNP2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms