Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms