Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms