Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Csmd2V9GX34 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms