Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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