Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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