Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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