Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sema6cQ9WTM3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sema6cQ9WTM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sema6cQ9WTM3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sema6cQ9WTM3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms