Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc2Q9R244 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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