Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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