Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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